Au début de la saison 2012/13, Aerni a pu s'imposer en Coupe d'Europe et a réalisé plusieurs classements dans le top 10. Il a ensuite été nominé pour le slalom parallèle City Event le jour de l'an 2013 à Munich , où il a repris la place de quota pour Beat Feuz, blessé . Bien qu'il ait été éliminé en huitièmes de finale, il a reçu ses premiers points en Coupe du monde . Deux jours plus tard, le 3 janvier 2013, Aerni remportait pour la première fois une course de Coupe d'Europe. Aux Championnats du monde juniors en 2013 , il a remporté la médaille d'argent dans la compétition par équipe et a terminé quatrième au slalom. Lors de la deuxième manche du slalom de Bormio le 6 janvier 2014, il est passé de la 27e à la 10e position finale et a ainsi réalisé son premier classement dans le top 10 dans une course de Coupe du monde. 18 jours plus tard, il a obtenu son meilleur résultat en Coupe du monde à ce jour avec la 5e place du slalom à Kitzbühel . Au Championnat du monde junior en 2014, il a remporté deux autres médailles d'argent (compétition par équipe et slalom). Finalement, il a remporté la victoire avec l'équipe suisse lors de la finale de la saison à Lenzerheide le 14 mars 2014, devant les États - Unis et l' Autriche .
Lors de la saison 2014/15, Aerni n'a pu se classer qu'une seule fois dans le top 10 d'une course de Coupe du monde; cinq fois, il a été soit éliminé, soit il ne s'est pas qualifié pour le deuxième tour. Une image similaire a émergé lors de la saison 2015/16: la cinquième place du slalom de Madonna di Campiglio le 22 décembre 2015 a été opposée par cinq autres noughties. La saison 2016/17 s'est également déroulée de la même manière au départ, avec trois top 10 et quatre annulations. Grâce à une septième place dans la combinaison de Santa Caterina le 29 décembre 2016, il s'est assuré une place de départ dans cette discipline pour les Championnats du monde 2017 à Saint-Moritz . Là, il a eu la préférence des entraîneurs sur le vainqueur du combiné du Lauberhorn Niels Hintermann et a pris la 30e place dans la descente combinée, ce qui lui a permis de concourir premier dans la course de slalom. Avec un meilleur temps clair, il a laissé derrière lui tous ceux qui partaient après lui, sur quoi il a remporté la médaille d'or avec un centième de seconde d'avance sur Marcel Hirscher . À la fin de la saison, il remporte deux titres de champion de Suisse.
Au début de la saison 2017/18, Aerni a obtenu la quatrième place du slalom de Levi's , le meilleur résultat de sa carrière en Coupe du monde à ce jour. Le 22 décembre 2017, il a terminé sur le podium pour la première fois du slalom nocturne de Madonna di Campiglio , à seulement quatre centièmes de seconde du vainqueur Marcel Hirscher . Aux Jeux olympiques d'hiver de 2018 à Pyeongchang , le joueur de 24 ans a remporté la médaille d'or dans la compétition par équipe organisée pour la première fois le 24 février en équipe suisse (avec Wendy Holdener , Denise Feierabend , Daniel Yule et Ramon Zenhäusern ).
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