herbier

Vitellaria paradoxa , preuve d'herbier de l'Herbier Senckenbergianum
Etuve de séchage de spécimens d'herbier à partir d'un réchaud à gaz et d'un cadre en bois, Herbier de l' Université de Ouagadougou .

Un herbier ou herbier (du latin herba « herbe ») est une collection de plantes ou de parties de plantes conservées (principalement séchées et pressées) (exsiccate) à des fins scientifiques ou pour ceux qui s'intéressent à la botanique . Les herbiers scientifiques possèdent parfois aussi des collections partielles de matériel conservé humide (dans l'alcool) ou des collections de bois (xylarium).

Des plantes individuelles ou leurs parties sont collées sur une feuille d'herbier en tant qu'unité reconnaissable (document d'herbier). Ils doivent provenir d'un événement de collecte et les circonstances de la découverte doivent être documentées (date, lieu, lieu, collectionneur, etc.).

But d'un herbier

Un herbier permet au botaniste de comparer des plantes d'origines différentes et de vérifier des déterminations incertaines (" herbier comparatif") ou de prouver la présence de certaines espèces sur leurs lieux de croissance ("herbier documenté"). En évaluant les herbiers plus anciens, les changements de fréquence ou les changements dans les zones de distribution peuvent souvent être retracés. La (ré-)identification ultérieure d' une plante dans l'herbier est presque toujours possible ; à savoir, les structures spatiales sont conservées pendant le séchage et le pressage. Les couleurs peuvent s'estomper ou changer ; Cependant, on utilise certaines "règles empiriques" - on sait donc que les parties jaunes des plantes noircissent lentement après séchage.

Dans la plupart des cas, les clés d'identification et les flores reposent également sur la comparaison de spécimens d'herbier ; ce n'est que rarement et dans des cas exceptionnels que les espèces, qui sont souvent rares et qui poussent dans des régions très espacées et inaccessibles, peuvent être comparées directement sur le terrain. Dans certains cas, paradoxalement, cela permet d'identifier plus facilement des spécimens d'herbier d'espèces rares jusqu'à l'espèce que des spécimens vivants directement sur le site. Outre la forme et la couleur, les dimensions telles que la longueur et la largeur des organes végétaux des plantes conservées diffèrent très souvent de celles des spécimens frais. Cela doit être pris en compte lors de la comparaison.

La création d'un herbier était auparavant un préalable au pré-examen en tant que pharmacien . Encore aujourd'hui, de nombreuses universités en biologie et cours apparentés exigent la création d'un petit herbier comme exercice. Dans certains cas, un petit herbier est mis en place dans le cadre du cours de biologie à l'école ; les exigences sont bien sûr beaucoup plus faibles ici.

Herbiers comme collections

Un herbier scientifique est un cas particulier de collection de recherche (ou collection scientifique), avec les tâches et problèmes habituels d'une telle institution. Il est généralement géré par un conservateur qui, selon la taille de la collection, est épaulé par des assistants de collection et du personnel technique. Les herbiers plus petits avec moins d'environ 50 000 spécimens d'herbier sont souvent confrontés à des problèmes considérables à cet égard. Souvent, aucun conservateur spécial à temps plein n'est désigné, il est prévu qu'un autre employé du musée, de l'université ou d'une autre institution qui maintient l'herbier s'occupe de cette tâche en plus de ses autres tâches. Pour la conservation d'une collection encore plus petite, estimée approximativement, un temps requis d'un minimum absolu d'un quart d'un poste à temps plein est estimé. En plus des tâches de vérifiable et de comparaison, toute une gamme d'autres tâches doivent être prises en compte. L'objectif est de fournir aux étudiants et aux facultés du matériel à des fins de pratique et de formation. Les scientifiques d'autres disciplines, par exemple les experts en végétation et les biogéographes, mais aussi les archéologues (archéobotanistes) et bien d'autres devraient être soutenus dans leur travail en tant que service. Les demandes d'autres institutions concernant le matériel de collecte doivent être traitées et, si nécessaire, leur expédition organisée. Idéalement, les questions de botanique et de biodiversité en général devraient être informées et annoncées publiquement , les chercheurs amateurs et amateurs devraient être soutenus et le public devrait être informé par la fourniture de données.

Un problème particulier, avec une importance croissante, est la gestion des données. Comme dans d'autres collections, les données étaient stockées dans des catalogues et sur des fiches. Lors du stockage des données dans les systèmes informatiques, comme dans tous les cas comparables, des formats de registre et d'échange standardisés doivent être développés et garantis. Une maintenance constante de la base de données est nécessaire, par exemple si le nom scientifique valide d'une espèce change ou si un spécimen spécifique à l'espèce est attribué à une espèce différente par un autre botaniste. Les plateformes d'échange de données telles que GBIF ( Global Biodiversity Information Facility ), Darwin Core (standard du Taxonomic Databases Working Group (TDWG)) ou BioCase (Biological Collection Access Service) et d'autres ne sont pas toujours totalement compatibles entre elles.

Preuve d'herbier

Un enregistrement d'herbier est généralement un spécimen séché et aplati d'une plante ou, dans le cas de plantes plus grandes, une collection de parties de celle-ci, telles que des pousses feuillues ou des brindilles, des inflorescences et des fleurs, etc., qui est collé sur un carton ou feuille de papier. Les informations essentielles sont documentées sur une étiquette apposée, sans qu'aucune preuve ait peu de valeur scientifique. Dans le cas d'espèces végétales difficiles à conserver sous cette forme en raison de leur morphologie, par exemple parce qu'elles sont trop grandes et volumineuses ou qui se déforment au séchage, d'autres modes de conservation sont utilisés en remplacement. Il existe également des méthodes standardisées pour les spécimens d'herbier de mousses , de lichens et de champignons , qui diffèrent de la procédure pour les plantes vasculaires.

Les herbiers privés plus petits ne satisfont souvent pas aux exigences de qualité des herbiers scientifiques, mais souvent ne s'efforcent même pas de les atteindre.
Livre d'herbier avec des plantes japonaises, Siebold Collection Leiden, 1825 ?

La plante récoltée pour une feuille d'herbier doit être complète et de bonne qualité. Dans le cas de plantes de grande taille, les parties de la plante pertinentes pour la détermination (fleurs/fruits, feuilles, pousses, racines) doivent être présentes. Le matériel végétal doit être pressé et séché sans dommage (mécanique, attaque fongique, jaunissement) et les composants intéressants doivent être clairement visibles. Afin de créer un enregistrement d'herbier, les plantes doivent d'abord être collectées. À cette fin, des spécimens aussi typiques que possible et représentatifs de la population doivent être sélectionnés. En règle générale, seuls les spécimens en fleurs ou en fruits sont sélectionnés. Habituellement, plusieurs spécimens doivent toujours être herbiers. Si des parties d'individus différents sont montées sur une arche pour compléter le tableau, cependant, il y a un risque qu'elles représentent des espèces végétales différentes. Le collectionneur doit avoir une connaissance botanique afin qu'il sache quelles caractéristiques sont essentielles pour le groupe respectif et sélectionne le matériel en conséquence ; ainsi certaines espèces ne peuvent être déterminées qu'à l'état de floraison ou de fructification. Autrefois, les fûts de botanisation étaient utilisés pour la collecte , aujourd'hui les sacs en plastique servent à cet effet. Certaines plantes, par exemple de la famille des Papavéracées , doivent être pressées au champ, sinon les grappes vont se désagréger (ici : perdre les pétales).

Il existe plusieurs méthodes de traitement ultérieur des plantes récoltées, qui ont leurs avantages et leurs inconvénients en fonction des circonstances extérieures (conditions climatiques, encombrement lors des déplacements, etc.). Si possible, les plantes sont généralement séchées et pressées immédiatement après. Pour presser les plantes, on utilise soit des presses à plantes à grilles spéciales avec ressorts de tension, soit, dans le cas simple, la plante est placée entre du papier buvard (ou du papier journal) et des planches de bois et alourdie. Le papier utilisé pour le séchage doit être changé régulièrement, sinon les plantes risquent de moisir, mais la feuille de papier buvard avec le document herbier lui-même ne doit jamais être changée tant qu'elle n'est pas complètement sèche. Des entretoises sont souvent ajoutées pour permettre à l'air de circuler. Il est important de marquer clairement les reçus à ce stade afin d'éviter les confusions par la suite. Alors qu'un simple séchage entre papier absorbant peut être suffisant dans des conditions optimales, il est généralement nécessaire de sécher artificiellement les reçus sur une source de chaleur.

Surtout dans les climats tropicaux, les spécimens d'herbier sont alternativement stockés dans un premier temps à l'aide d'alcool pour être ensuite séchés dans de meilleures conditions. Cette procédure est connue sous le nom de méthode de Schweissfurth. A cet effet, les documents pressés entre du papier buvard sont placés dans des sacs plastiques hermétiquement fermés dans de l'alcool à l'abri de l'air.

Les plantes complètement séchées sont ensuite montées sur une arche d'herbier pour un stockage permanent. Pour éviter les dommages lors de la manipulation, les plantes sont collées à la feuille d'herbier avec des bandes de papier caoutchouté. Le collage à plat, voire le soudage des arcades sous film plastique, qui est parfois utilisé dans les herables laïques, ne sont pas acceptables dans les collections scientifiques. Les informations minimales sur une fiche d'herbier sont le lieu de découverte (si possible coordonnées GPS), la date de découverte et le chercheur. Habituellement, le nom scientifique de la plante est également donné. Il est d'usage que le collectionneur attribue un numéro de collection unique à chaque spécimen d'herbier. Les informations sur l'emplacement, la fréquence, les plantes d'accompagnement et d'autres observations sont également importantes pour les futurs observateurs. De plus, il faut noter des caractéristiques qui ne peuvent être déterminées que chez les plantes vivantes (hauteur totale des arbres, couleur des fleurs fraîches, etc.).

Afin d'assurer un accès permanent aux plantes récoltées, les plantes herbacées sont stockées dans des conditions climatiques contrôlées. L'entreposage à sec est important pour empêcher la pourriture et la croissance de moisissures . Les poux de la poussière , les coléoptères des musées ou d'autres parasites de collection qui vivent sur les plantes séchées sont mieux combattus par un gel occasionnel . Les feuilles d'herbier individuelles sont idéalement stockées horizontalement dans des compartiments plats. Les avis sur l'utilisation d'un film plastique pour le revêtement au lieu du papier sont partagés. Le nom d'une espèce végétale renvoie souvent à un spécimen séché spécifique, l' holotype de cette espèce, dans un herbier scientifique.

Les espèces végétales peuvent, conformément à la législation nationale ou aux traités et accords internationaux, faire l' objet d'une protection des espèces . En Allemagne, par exemple, cela s'applique aux espèces qui sont « spécialement » ou « strictement » protégées en vertu de l' ordonnance fédérale sur la protection des espèces (BArtSchV). Pour cette raison, des informations précises sur les espèces végétales présentes doivent être obtenues avant l'herborisation. Le cas échéant, une dérogation doit être demandée auprès de l'autorité compétente.

Preuve d'herbier pour l'extraction d'ADN

Outre leur importance traditionnelle, les spécimens d'herbier d'aujourd'hui, comme d'autres spécimens des collections scientifiques, sont de plus en plus importants pour l'obtention de spécimens d'ADN, dont la séquence est une base importante pour la taxonomie et la systématique ( phylogénomique ) ; De plus, certains documents nommés servent de référence pour l'identification des espèces à l'aide de codes-barres ADN . En raison du développement ultérieur des techniques correspondantes (appelées « séquençage de nouvelle génération »), il est désormais possible d'utiliser des documents plus anciens avec un ADN dégradé en raison de la dégradation liée à l'âge ; Même les spécimens traités à l'alcool selon la méthode de Schweissfurth, qui étaient auparavant difficilement utilisables, fournissent désormais du matériel utilisable. Cependant, l'utilisation d'anciens spécimens d'herbier est méthodologiquement extrêmement difficile car les échantillons sont souvent contaminés par de l'ADN étranger par contamination, ce qui peut fausser les résultats. Les méthodes plus complexes développées pour l' ADNa doivent être utilisées ici.

Herbier virtuel

Article détaillé : Herbier virtuel

En attendant, certains herbiers ont numérisé des parties de leurs collections afin de pouvoir les rendre accessibles à un large public, par exemple via Internet. Herbar Digital était un projet de recherche visant à rationaliser la virtualisation (numérisation) des preuves botaniques. Les routes de numérisation de masse ont été utilisées dans les années 2010.

Émergence

Au début de la période moderne, le terme "herbier" désignait initialement un livre d'herbes . D'autre part, les collections de plantes séchées étaient appelées "Herbarium vivum", "Herbarium siccum" ou "Hortus hiemalis" (latin pour "jardin d'hiver") car elle était censée remplacer la vue des plantes vivantes dans le jardin en hiver. Les premières mentions de plantes pressées datent du XVe siècle. Les premiers herbiers ont été aménagés dans la première moitié du XVIe siècle avec la création de jardins botaniques en Italie centrale. Le premier herbier conservé, aujourd'hui à Florence, est celui du botaniste et prêtre italien Michele Merini , qui a été aménagé vers 1545. L'invention est attribuée à Merini, mais plus souvent à son professeur Luca Ghini (1490-1556), qui a fondé l'Orto botanico à Pise, le premier jardin botanique du monde. Les premiers herbiers étaient pour la plupart réunis dans un livre (codex), analogue aux livres de plantes médicinales. Andrea Cesalpino , par exemple, a donné un tel « liber ex plantis agglutinatis » au duc Cosme Ier de Médicis . L'herbier de Leonhard Rauwolf , dans lequel il a collecté 513 feuilles de plantes de son voyage en Orient, est conservé aujourd'hui à Leyde . Le plus ancien herbier allemand conservé est probablement celui de Caspar Ratzenberger de 1592, il est aujourd'hui exposé au musée d'histoire naturelle Ottoneum de Kassel. Alors que ces premiers herbiers étaient au départ plus ou moins des cabinets de curiosités rassemblés, la mise en place d'herbiers systématiques a commencé à la suite des travaux de John Ray, Joseph Pitton de Tournefort, Carl von Linné, Augustin Pyrame de Candolle et d'autres chercheurs de leur temps. L'herbier du botaniste suisse Caspar Bauhin est l'un des premiers dans lequel toutes les espèces végétales connues ont été collectées selon la systématique établie par Linné. Il utilisait désormais également son herbier (maintenant conservé à Bâle) comme moyen de recherche, dans lequel il comparait les plantes collectées les unes avec les autres et sur cette base faisait des diagnostics différentiels. L'herbier du botaniste irlandais Hans Sloane (1660-1753) a été acheté par le gouvernement britannique après sa mort ; il forme la base de l'herbier du Natural History Museum . Carl von Linné a construit son travail, fondamental pour la taxonomie végétale, principalement sur la base des herbiers d'autres botanistes contemporains, sur celui du juriste néerlandais George Clifford III. il a écrit son ouvrage Hortus Cliffortianus . L'herbier de Linné lui-même, qui ne contient « que » 14 000 spécimens, a été vendu à l'Angleterre par sa veuve après sa mort ; il est désormais à la Linnean Society of London . De nombreux documents qui y sont conservés peuvent être consultés sous forme numérique.

Grands herbiers

Les herbiers scientifiques sont généralement rattachés aux jardins botaniques , aux musées d' histoire naturelle et d'histoire naturelle ou aux instituts universitaires de biologie, principalement spécialisés en botanique. Tous les herbiers grands et importants, actifs au niveau international, sont répertoriés dans le répertoire "Index Herbariorum". Celui-ci est apparu pour la première fois en 1935, à l'époque encore sous presse. Au 1er décembre 2016, l'indice Herbariorum indique 2962 herbiers scientifiques actifs dans 176 pays à travers le monde. Ceux-ci contiennent 381308064 spécimens d'herbier. Au total, 11548 scientifiques sont employés dans les herbiers. La plupart des herbiers se trouvent, avec 792, en Amérique du Nord et, avec 695, en Europe, 69 d'entre eux en Allemagne, 19 en Autriche, 16 en Suisse. En revanche, il n'y a que 47 herbiers dans toute l'Afrique.

Les dix plus grands herbiers du monde (selon l'Index Herbariorum) sont, par ordre décroissant :

D'autres grands herbiers dans les pays germanophones sont par exemple

Littérature

  • Sven Linnartz : L'excursion botanique - étape par étape vers votre propre herbier . Quelle & Meyer-Verlag, Wiebelsheim 2007 (2e édition), ISBN 978-3-494-01433-3 .
  • Christof Nikolaus Schröder : Catalogue des abréviations utilisées sur les spécimens d'herbier - Catalogus Abbreviationum in Schedis Herbariorum usitatorum. Dans : Kochia 12 (2019) : 37-67, ISSN 1863-155X. en ligne

Voir également

liens web

Commons : Herbaria  - collection d'images, de vidéos et de fichiers audio
Wiktionnaire : Herbier  - explications de sens, origines des mots, synonymes, traductions

Preuve individuelle

  1. John Parnell, Tim Rich, Andrew McVeigh, Astrid Lim, Sean Quigley, David Morris, Zeno Wong (2014) : L'effet des méthodes de conservation sur la morphologie des plantes. Taxon 62 (6) : 1259-1265. doi: 10.12705 / 626.3
  2. http://www.uni-bamberg.de/fileadmin/020722/Downloads/Anlegen_eines_Herbariums_und_eines_Transekts.pdf
  3. ^ Neil Snow (2005) : Conserver avec succès de plus petites collections d'herbiers et d'histoire naturelle dans les milieux universitaires. BioScience 55 (9) : 771-779. doi : 10.1641 / 0006-3568 (2005) 055 [0771 : SCSHAN] 2.0.CO ; 2
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  5. ^ D'après AG Miller & JA Nyberg (mise à jour : AP Davis) : Collecte de bons d'herbier. Chapitre 27 dans L. Guarino, V. Ramanatha Rao, E. Goldberg (éditeurs). Collecte de la diversité phytogénétique : Directives techniques - Mise à jour 2011. Bioversity International, Rome, Italie. ISBN 978-92-9043-922-6 . en ligne et télécharger sur la base de connaissances Crop Genebank
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  7. Leon Perrie & Lara Shepherd (2014) : Extraction d'ADN à partir de spécimens d'herbier. Australasian Systematic Botany Society Newsletter 160 : 8-9.
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  11. Dietrich von Engelhardt (2011) : Luca Ghini (1490-1556). Il padre fondatore della botanica moderna nel contesto dei rapporti scientifici europei del sedicesimo secolo. Annali del Museo Civico di Rovereto, Sezione di Archeologia, Storia e Scienze naturali 27 : 227-246.
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  17. Herbiers et bibliothèques de Harvard
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  19. Herbier Haussknecht, Iéna
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